（６月30日）
　辞職（大臣官房付）　猪俣志野

（７月５日）
　大臣官房付（外務事務官＝在フランス日本国大使館一等書記官）　壹貫田剛史

（７月９日）
　研究開発局付（国立研究開発法人物質・材料研究機構秘書室長）　阿部陽一

（７月10日）
　大臣官房国際課長（佐賀県副知事）　小林万里子

（７月12日）
　研究振興局振興企画課学術企画室長（文化庁政策課専門官）河村雅之
　大臣官房付（厚生労働省医政局医事課医師臨床研修推進室長）児玉大輔
　総務省出向（情報流通行政局情報流通振興課情報活用支援室長就任予定）（大臣官房文教施設企画・防災部参事官（施設防災担当）付参事官補佐）　赤間圭祐
　厚生労働省出向（医政局医事課医師臨床研修推進室長就任予定）（研究振興局振興企画課学術企画室長）　錦泰司
　カジノ管理委員会出向（事務局監督調査部規制監督課犯罪収益移転防止対策室長就任予定）（大臣官房付）　村瀬剛太